#NEXUS BEGIN TAXA; dimensions ntax=8; taxlabels A B C D E F G H; END; BEGIN CHARACTERS; dimensions nchar=5; format datatype=protein missing=? gap=-; charlabels one two three four five; matrix A --QNE B --QNE C TWO-- D THREE E FORE- F FIVE- G SIX-- H SEVEN; END; BEGIN TREES; tree basal_trifurcation = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):1):1,(E:1,F:1):2,(G:1,H:1):2); tree bush = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):1):1,((E:1,F:1):1,(G:1,H:1):1):1); tree bush_branchlength_negative = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):-0.25):1,((E:1,F:1):1,(G:1,H:1):1):1); tree bush_branchlength_scientific = (((A:1,B:2e+01):1,(C:9e-01,D:1):1):1,((E:1,F:9E-01):1,(G:2E+01,H:1):1):1); tree bush_branchlength_zero = (((A:1,B:1):1,(C:0,D:1):1):1,((E:1,F:1):1,(G:1,H:1):1):1); tree bush_cladogram = (((A,B),(C,D)),((E,F),(G,H))); tree bush_extended_root_branch = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):1):1,((E:1,F:1):1,(G:1,H:1):1):1):1; tree bush_inode_labels = (((A:1,B:1)AB:1,(C:1,D:1)CD:1)ABCD:1,((E:1,F:1)EF:1,(G:1,H:1)GH:1)EFGH:1); tree bush_inode_labels_partial = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):1):1,((E:1,F:1)EF:1,(G:1,H:1)GH:1)EFGH:1); tree bush_inode_labels_quoted1 = (((A:1,B:1)"inode AB":1,(C:1,D:1)"inode CD":1)"inode ABCD":1,((E:1,F:1)"inode EF":1,(G:1,H:1)"inode GH":1)"inode EFGH":1); tree bush_inode_labels_quoted2 = (((A:1,B:1)'inode AB':1,(C:1,D:1)'inode CD':1)'inode ABCD':1,((E:1,F:1)'inode EF':1,(G:1,H:1)'inode GH':1)'inode EFGH':1); tree 'bush quoted string name2' = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):1):1,((E:1,F:1):1,(G:1,H:1):1):1); tree bush_uneven = (((A:1,B:2):1,(C:1,D:2):1):1,((E:1,F:2):1,(G:1,H:2):1):1); tree ladder = (((((((A:1,B:1):1,C:2):1,D:3):1,E:4):1,F:5):1,G:6):1,H:7); tree ladder_cladogram = (((((((A,B),C),D),E),F),G),H); tree ladder_uneven = (((((((A:1,B:2):1,C:2):1,D:4):1,E:4):1,F:6):1,G:6):1,H:8); tree rake = (A:1,B:1,C:1,D:1,E:1,F:1,G:1,H:1); tree rake_cladogram = (A,B,C,D,E,F,G,H); END;